《花样少年少女》围绕卢瑞希展开。瑞希在电视上看到跳高选手左以泉的精彩表现后，便深深喜欢上了他。为了接近以泉，她不惜女扮男装转入泉就读的男校。在学校里，瑞希结识了室友金秀伊等一众好友。秀伊单纯善良，很快和瑞希成为了好兄弟。然而，瑞希女扮男装的身份面临诸多挑战，她要时刻小心不被他人发现自己的真实性别。以泉虽然一开始对瑞希的行为感到奇怪，但在相处过程中两人关系逐渐亲密。随着相处，以泉也对瑞希产生了别样的感情。故事中既有校园生活的轻松搞笑，也有少年少女之间纯真美好的情感，展现了青春时期的活力与懵懂。