《北岸疑云》围绕着北岸小镇上一系列离奇事件展开。警探艾米丽被调派到这个看似平静的小镇，然而刚到不久，就发生了一起神秘的失踪案。年轻女孩克莱尔在一个雨夜突然消失，现场没有留下任何明显线索。艾米丽开始深入调查，随着调查的推进，她发现克莱尔的失踪似乎与小镇上一个神秘组织有关。这个组织行事隐秘，涉及一些非法活动。与此同时，艾米丽还遭遇了来自各方的压力，有人试图阻止她继续调查。在调查过程中，艾米丽结识了当地的记者杰克，杰克利用自己的资源帮助艾米丽寻找线索。他们抽丝剥茧，逐渐揭开了隐藏在小镇平静表象下的黑暗真相，最终能否成功找到克莱尔并将幕后黑手绳之以法，成为了故事的最大悬念。