《无厘头科学研究所第二季》延续了第一季的搞怪风格，以趣味方式探索科学知识。节目中，几位性格各异的研究员再度集结，开启新的科学冒险。在“水果发电大挑战”环节，研究员们用常见的苹果、柠檬等水果，尝试让小灯亮起，过程中状况百出，有人连接线路错误，有人水果选得不对，但最终还是成功完成实验，还讲解了背后的化学原理。还有“空气大炮实验”，他们用废旧纸箱制作大炮，发射出空气炮弹，研究员们互相“攻击”，在欢笑中展示了空气动力学知识。节目寓教于乐，让观众在无厘头氛围中轻松学科学。