《黑太阳731》以侵华日军的731部队为背景，揭露了其令人发指的罪行。影片中，731部队将无数无辜百姓当作实验品，进行细菌实验、活体解剖等惨无人道的行径。他们把人称作“马路大”，完全不将其当人看待。医生石井四郎带领手下进行各种罪恶实验，如将人关进密封舱，测试在不同气压下人体的反应；把人冻伤后再进行解冻实验，观察肢体坏死情况。影片还展现了日军用活人培养细菌，然后投放到中国村庄，导致大量村民感染死亡的场景。这些真实又残酷的画面，让观众深刻认识到当年日军的残暴与冷血，是一部极具震撼力和警示意义的影片。