《太空堡垒第三季》延续前作剧情，故事围绕着地球防卫军与外星势力展开。在这一季中，人类面临着新的强大敌人因维德人。因维德人来到地球是为了寻找他们赖以生存的史前能量——花朵。瑞克·卡特等地球防卫军成员带领众人顽强抵抗因维德人的进攻。 在战斗过程中，人类与因维德人之间的矛盾不断升级。同时，一些因维德人开始对自身的使命产生怀疑，与人类产生了情感上的交流和冲突。比如兰瑟，他在与人类的接触中逐渐改变了对人类的看法。 随着剧情推进，双方展开了一场又一场惊心动魄的太空大战和地面战斗。人类在艰难的处境中不断寻找对抗因维德人的方法，最终在一系列的战斗和谈判后，双方达成了某种和解，地球也迎来了新的和平曙光。