咲太在图书馆遇见了一身兔女郎装扮的学姐樱岛麻衣，然而周围人却好似看不到她。原来，这是“思春期症候群”现象，因麻衣人气下滑后被众人忽视，导致自己也逐渐被世界遗忘。咲太决定帮助麻衣，在相处中两人感情升温。之后，咲太的妹妹双叶也患上了“思春期症候群”，身体分裂出另一个人格。咲太与双叶一起探寻真相，解决问题。同时，学妹古贺朋绘也陷入了“思春期症候群”的困扰，她因对咲太的感情产生了一系列奇异事件。咲太不断在身边人的“思春期症候群”事件中奔走，在解决问题的过程中，他也对青春期的烦恼、爱情和友情有了更深的感悟。