《人类清除计划4》故事设定在清除夜这一特殊背景下。艾德里安是一名警察，他在清除夜执行任务时，目睹了无数惨绝人寰的暴力事件。一群反抗清除计划的人集结起来，他们中有勇敢的战士卡莉，还有智慧的领导者托马斯。他们决定在清除夜展开反击，不再坐以待毙。 在清除夜的混乱中，反抗者们与支持清除计划的极端势力展开了激烈对抗。艾德里安在与反抗者接触后，内心的正义被唤醒，决定加入他们。他们一边躲避着极端势力的追杀，一边寻找机会破坏清除计划的核心系统。最终，经过一番艰苦战斗，他们成功破坏系统，让清除计划暂时停止，城市也从血腥与暴力中逐渐恢复平静。