《丹心谱》故事发生在“四人帮”倒行逆施的特殊时期。老中医方凌轩医术精湛、医德高尚，他坚决抵制“四人帮”在医疗界的阴谋。方凌轩的女儿方静淑是医院的医生，女婿丁文中起初在“四人帮”爪牙的威逼利诱下有所动摇。“四人帮”妄图利用所谓的“新药试验”来达到不可告人的政治目的，方凌轩对此坚决反对，他不顾个人安危，与“四人帮”及其在医院的代理人展开了激烈斗争。在斗争过程中，方凌轩始终坚守自己的原则和底线，用自己的智慧和勇气揭露敌人的阴谋。最终，随着“四人帮”的覆灭，正义得以伸张，方凌轩等坚守正义的人们取得了胜利。影片通过方凌轩一家的遭遇，展现了那个特殊时代正义与邪恶的较量。