《宇宙小子第二季》延续了第一季的奇幻风格，围绕小男孩史蒂文和石榴石、紫水晶、珍珠三位宝石战士展开。史蒂文努力学习运用自己的宝石能力，在这个过程中闹出不少笑话，却也在一次次实践中不断成长。他们继续守护地球，对抗各种邪恶的宝石入侵者。在本季中，他们遇到了新的敌人，像融合宝石碧玉，她强大且充满敌意，给宝石战士们带来了巨大挑战。同时，史蒂文与宝石们的关系也更加深厚，他逐渐理解了宝石们的过去和使命。此外，还揭开了许多关于宝石世界的秘密，比如宝石们的母星以及它们的起源故事，让观众对这个神秘的宇宙有了更深入的了解。