《淘气小女巫第三季》延续了前两季的奇幻风格，故事围绕着古灵精怪的小女巫米娅展开。米娅拥有神奇的魔法，但总是在不经意间闹出各种笑话。在这一季中，米娅所在的魔法学校迎来了新的挑战，一股神秘的黑暗力量开始在校园中作祟。米娅和她的好朋友们，勇敢的小精灵露露、聪明的小巫师汤姆，决定一起揭开黑暗力量的秘密。他们在魔法森林中寻找线索，遭遇了会说话的树精、调皮的小精灵等奇妙生物。在一次与黑暗势力的正面交锋中，米娅发挥出了自己的潜力，用魔法保护了大家。随着故事的推进，他们逐渐发现黑暗力量的源头，一场正义与邪恶的最终对决即将展开。