《使徒行者粤语》围绕卧底展开故事。丁小嘉是沐足店打工妹，实则是刑事情报科卧底，负责与失联卧底接头。她在寻找过程中，意外卷入黑帮争斗。薛家强是黑帮成员，重情重义，他不知自己曾是警方卧底。高级督察卓凯在一次行动中，手下卧底全部失联，他四处奔走寻找线索。在追查过程中，卓凯与丁小嘉合作，逐渐揭开背后巨大阴谋。各方势力相互博弈，卧底们在黑白之间艰难抉择。有人为了正义坚守，有人在利益诱惑下动摇。剧中既有紧张刺激的枪战场面，也有卧底们内心挣扎的细腻刻画，展现了卧底生活的复杂与危险。