《剧场版 佐佐木与宫野》延续了电视动画的故事，聚焦于佐佐木和宫野这对恋人。宫野一直对自己的性取向有所迷茫，在与佐佐木的相处中逐渐敞开心扉，两人确定了恋爱关系。然而，他们的感情面临着新的挑战。宫野的好友草壁对佐佐木产生了误会，认为他会伤害宫野，从而对佐佐木充满敌意。与此同时，学校里关于他们恋情的传闻也开始流传，给他们带来了不小的压力。但佐佐木和宫野相互信任，共同面对这些困难。他们在彼此的支持下，更加坚定了对这份感情的决心，一起走过了一段充满波折却又甜蜜的时光。