《太空堡垒第二季》承接第一季剧情，故事围绕着地球防卫军与天顶星人的持续对抗展开。瑞克·卡特等主角们继续在这场星际战争中奋战。天顶星人在见识到地球人的生活与情感后，内部开始出现分化。一部分天顶星人渴望和平，像伦克等，他们逐渐与地球人建立起友谊。 在这一季中，地球面临着新的危机，外星势力因天顶星人的战败而将目光投向地球。地球防卫军一边要应对外部新敌人的威胁，一边还要处理天顶星人内部的矛盾。瑞克在情感上也面临着抉择，他在丽莎和明美之间徘徊。随着剧情推进，各方势力不断碰撞，精彩的太空战斗场面接连上演，同时人物之间的情感纠葛也愈发复杂，共同构成了这一季紧张刺激又充满温情的故事。