《银河守护者第二季》承接前作，星爵等人继续以银河守护者的身份维护宇宙和平。在一次行动中，他们遭遇神秘敌人攻击，飞船受损迫降陌生星球。星爵意外得知自己的生父竟是天神组伊戈，伊戈带他来到自己创造的星球，向他展示强大能力并讲述身世。与此同时，卡魔拉与星云这对姐妹的矛盾进一步激化，星云为摆脱姐姐阴影，决心杀死卡魔拉。德拉克斯为给家人报仇，对敌人穷追不舍。格鲁特已从幼苗长成少年，天真活泼但也常闯祸。最终，众人发现伊戈的恐怖计划，他想利用星爵的力量将生命种子播撒到全宇宙，从而统治一切。银河守护者们团结一致，与伊戈展开决战，成功拯救宇宙。